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- 素材大小:
- 1.51 MB
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- 素材格式:
- .ppt
- 素材上传:
- ppt
- 上传时间:
- 2018-06-08
- 素材编号:
- 122781
- 素材类别:
- 学校PPT
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素材预览
这是一个关于生物信息学分析PPT课件,主要介绍了引言、生物信息学及其发展历史、生物信息学基础、生物信息学主要研究内容、生物信息学当前的主要任务等内容。内容 生物信息学的应用–医学 新药物设计基因芯片疾病快速诊断流行病学研究:SARS 人类基因组计划寄生虫基因组计划 生物信息学?--新兴的交叉学科 So, 生物信息学是一门交叉学科,它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方面,它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。 (美国人类基因组计划第一个五年总结报告,1995) 采用信息科学技术,借助数学、生物学的理论、方法,对 各种生物信息的收集、加工、储存、分析、解释的一门学 科。收集、加工、储存:计算机科学家分析、解释:生物学家 20世纪50年代:生物信息学开始孕育 20世纪60年代:生物分子信息在概念上将计算生物学和 计算机科学联系起来 20世纪70年代:生物信息学的真正开端(序列比对算法) 20世纪80年代初期:生物信息分析方法的发展 20世纪80年代以后:生物信息服务机构和数据库 20世纪90年代后:HGP促进生物信息学的迅速发展 生物信息学主要研究内容,欢迎点击下载生物信息学分析PPT课件哦。
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内容 生物信息学的应用–医学 新药物设计基因芯片疾病快速诊断流行病学研究:SARS 人类基因组计划寄生虫基因组计划 生物信息学?--新兴的交叉学科 So, 生物信息学是一门交叉学科,它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方面,它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。 (美国人类基因组计划第一个五年总结报告,1995) 采用信息科学技术,借助数学、生物学的理论、方法,对 各种生物信息的收集、加工、储存、分析、解释的一门学 科。 收集、加工、储存:计算机科学家分析、解释:生物学家 20世纪50年代:生物信息学开始孕育 20世纪60年代:生物分子信息在概念上将计算生物学和 计算机科学联系起来 20世纪70年代:生物信息学的真正开端(序列比对算法) 20世纪80年代初期:生物信息分析方法的发展 20世纪80年代以后:生物信息服务机构和数据库 20世纪90年代后:HGP促进生物信息学的迅速发展 生物信息学主要研究内容 1、生物分子数据的收集与管理 2、数据库搜索及序列比较 3、基因组序列分析 4、基因表达数据的分析与处理 5、生物大分子结构预测 生物分子信息的特征生物分子信息数据量大 生物分子信息复杂 生物分子信息之间存在着密切的联系生物信息学数据库资源生物信息学数据库资源 模式生物基因组计划 酵母、线虫、果蝇、细菌、拟南芥等共约50多种已完成,70余种正在进行。目前总量已达60亿碱基对! 生物信息学数据库资源三大基因数据库 Genbank Genbank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列,以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。 NCBI的网址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov。 EMBL核酸序列数据库 由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成,查询检索可以通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。 数据库网址是:http://www.ebi.ac.uk/embl/。 DDBJ数据库 日本DNA数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库,与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。 DDBJ的网址是:http://www.ddbj.nig.ac.jp/。 生物信息学数据库资源蛋白质序列数据库 PIR PIR是一个全面的蛋白质序列数据库,它是由美国生物医学基金会NBRF、日本的国际蛋白质信息数据库JIPID和德国的慕尼黑蛋白质序列信息中心MIPS合作建立和维护的。 PIR的网址是:http://pir.georgetown.edu/。 SwissProt 该数据库由瑞士日内瓦大学于1986年创建,目前由瑞士生物信息学研究所和欧洲生物信息学研究所EBI共同维护和管理。 数据库网址是:http://www.uniprot.org/。 序列比对序列比对两个序列的比对是指这两个序列中各个字符的一种一一对应关系,或字符的对比排列。分类:双比对,全局比对,局部比对,多序列比对。 AAGCTTAACGT AATCTTAACGT 序列比对序列比对两个序列的比对是指这两个序列中各个字符的一种一一对应关系,或字符的对比排列。分类:双比对,全局比对,局部比对,多序列比对。 AAGCTTAACGT AATCTTAACGT 序列的相似性 所以, 相似性的数值一定比一致性的要( ) 大 or 相等 or 小生物序列的同源性同源性(homology): 指从一些数据中推断出的两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论,属于质的判断。 就是说A和B的关系上,只有是同源序列,或者非同源序列两种关系。而说A和B的同源性为80%都是不科学的。 主要的blast程序 基因表达数据分析与处理基因芯片 生物信息学和基因芯片生物信息学在基因芯片中的应用生物大分子结构预测蛋白质结构预测 蛋白质的生物功能由蛋白质的结构所决定,蛋白质结构预测成为了解蛋白质功能的重要途径 蛋白质结构预测分为: 二级结构预测空间结构预测 Thank You!
生物信息学在蛋白质工程中的实际应用介绍PPT课件:这是一个关于生物信息学在蛋白质工程中的实际应用介绍PPT课件,主要介绍了什么是生物信息学、蛋白质研究常用的数据库、蛋白质序列分析和结构预测等内容。GenBank存储的数据类型基因组DNA数据库 染色体、大片段DNA(BAC或YAC)、基因、序列标签位点(STS) cDNA数据库 表达序列标签(EST)蛋白质数据库 非冗余数据库(nonredundant database) GSS 基因组测序序列随机的“经过单次测序”的基因组测序序列;粘粒/BAC/YAC序列外显子定位的基因组序列 Alu聚合酶链反应序列 EST cDNA克隆的一部分序列(300-800bp)。 EST序列通常是随机选出cDNA克隆并对其中一条链进行快速测序。 UniGene 一个基因的数据库条目,包含了所有这个基因对应的EST。 参考序列(RefSeq) 给出了一个对应于基因或蛋白质的索引号码,对应于最稳定、最被人承认的序列。 GenBank中对应于某个基因的索引号可能有上百个,但是对应于一个基因的RefSeq记录只有一个,或者在存在可变剪切的情况下对应不止一个,欢迎点击下载生物信息学在蛋白质工程中的实际应用介绍PPT课件哦。
生物信息学论文PPT素材:这是一个关于生物信息学论文PPT素材,主要介绍了生物信息学基本概念及发展历史、生物信息学主要研究内容、生物信息学当前的主要任务、GenBank数据库检索及其应用等内容。第五章 生物信息学 §1 生物信息学基本概念及发展历史 §2 生物信息学主要研究内容 §3 生物信息学当前的主要任务 §4GenBank数据库检索及其应用 ——Entrez检索功能 第一节 生物信息学基本概念及发展历史 概念(狭义)Bioinformatics (1)遗传信息的载体——DNA 遗传信息的载体主要是DNA 控制生物体性状的基因是一系列DNA片段 生物体生长发育的本质就是遗传信息的传递和表达 DNA通过自我复制,在生物体的繁衍过程中传递遗传信息 (3) DNA分子和蛋白质分子 都含有进化信息 通过比较相似的蛋白质序列,如肌红蛋白和血红蛋白,可以发现由于基因复制而产生的分子进化证据。通过比较来自于不同种属的同源蛋白质,即直系同源蛋白质,可以分析蛋白质甚至种属之间的系统发生关系,推测它们共同的祖先蛋白质,欢迎点击下载生物信息学论文PPT素材哦。
生物信息学论文PPT模板:这是一个关于生物信息学论文PPT模板,主要介绍了引言、生物信息学发展的三个阶段、生物信息学的主要研究内容、生物信息学中的信息、生物信息学面临的8大挑战、基因变异使人类独具说话能力等内容。1 生物信息学引论 Gào Gāng 郜刚 gaogang20002000@126.com 13835702330 物质 能量 信息 生命活动三要素: 北京华大基因研究中心生物信息学平台 主要从事数据处理、软件开发、数据库建立与维护、项目研发、大型机管理、系统与网络维护等方面工作。其中数据处理和项目研发以计算机为工具,结合生物、数学、物理等多学科知识,对测序产生的原始数据进行处理和分析,获得传统生物学实验工作无法得到的结果。 1.1 引言 1.1.1 生物信息学概念 20世纪是科学技术迅速发展的世纪,物理和化学的发展使我们可以清楚地认识物质的组成,从分子、原子、电子等各层次上深入地了解微观世界,而天文技术、空间技术的发展则使得我们可以了解地球以外的客观世界,以电子信息技术为龙头的工业技术的飞速发展,使得我们可以不断地改造世界,甚至为人类更加舒适地生活创造新的世界。生命科学在20世纪同样也得到了发展,生理学、 细胞生物学、分子生物学等学科的发展使我们从器官、组织、细胞、生物大分子等各个层次认识了生命的物质基础。生物与其他物质有本质的区别,生物并非只是物质的简单堆积,生物体的生长发育是生命信息控制之下的复杂而有序的过程,欢迎点击下载生物信息学论文PPT模板哦。