生物信息学论文PPT素材下载

这是一个关于生物信息学论文PPT素材，主要介绍了生物信息学基本概念及发展历史、生物信息学主要研究内容、生物信息学当前的主要任务、GenBank数据库检索及其应用等内容。第五章 生物信息学 §1 生物信息学基本概念及发展历史 §2 生物信息学主要研究内容 §3 生物信息学当前的主要任务 §4GenBank数据库检索及其应用 ——Entrez检索功能 第一节 生物信息学基本概念及发展历史 概念（狭义）Bioinformatics (1)遗传信息的载体——DNA 遗传信息的载体主要是DNA 控制生物体性状的基因是一系列DNA片段 生物体生长发育的本质就是遗传信息的传递和表达 DNA通过自我复制，在生物体的繁衍过程中传递遗传信息 (3) DNA分子和蛋白质分子 都含有进化信息 通过比较相似的蛋白质序列，如肌红蛋白和血红蛋白，可以发现由于基因复制而产生的分子进化证据。通过比较来自于不同种属的同源蛋白质，即直系同源蛋白质，可以分析蛋白质甚至种属之间的系统发生关系，推测它们共同的祖先蛋白质，欢迎点击下载生物信息学论文PPT素材哦。

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第五章 生物信息学 §1 生物信息学基本概念及发展历史 §2 生物信息学主要研究内容 §3 生物信息学当前的主要任务 §4GenBank数据库检索及其应用 ——Entrez检索功能 第一节 生物信息学基本概念及发展历史 概念（狭义） Bioinformatics (1)遗传信息的载体——DNA 遗传信息的载体主要是DNA 控制生物体性状的基因是一系列DNA片段 生物体生长发育的本质就是遗传信息的传递和表达 DNA通过自我复制，在生物体的繁衍过程中传递遗传信息 (3) DNA分子和蛋白质分子 都含有进化信息 通过比较相似的蛋白质序列，如肌红蛋白和血红蛋白，可以发现由于基因复制而产生的分子进化证据。通过比较来自于不同种属的同源蛋白质，即直系同源蛋白质，可以分析蛋白质甚至种属之间的系统发生关系，推测它们共同的祖先蛋白质。 第一部遗传密码已被破译，但对密码的转录过程还不清楚，对大多数DNA非编码区域的功能还知之甚少 对于第二部密码，目前则只能用统计学的方法进行分析 无论是第一部遗传密码，还是第二部遗传密码，都隐藏在大量的生物分子数据之中。生物分子信息的特征生物分子信息数据量大 生物分子信息复杂 生物分子信息之间存在着密切的联系 3、生物信息学的发展历史 20世纪50年代，生物信息学开始孕育 20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算 生物学和计算机科学联系起来 20世纪70年代，生物信息学的真正开端 20世纪70年代到80年代初期 ，出现了一系列著 名的序列比较方法和生物信息分析方法 20世纪80年代以后，出现一批生物信息服务机 构和生物信息数据库 20世纪90年代后 ，HGP促进生物信息学的迅速 发展 生物信息学主要研究内容 1、生物分子数据的收集与管理 2、数据库搜索及序列比较 3、基因组序列分析 4、基因表达数据的分析与处理 5、蛋白质结构预测 迄今为止，生物学数据库总数已超过500个核酸序列数据库有GenBank、EMBL、DDBJ等蛋白质序列数据库有SWISS-PROT、PIR、OWL、NRL3D、TrEMBL等三维结构数据库有PDB、NDB、 CCSD 、 BioMagResBank 等与蛋白质结构相关的数据库有SCOP、CATH、FSSP、3D-ALI、DSSP等与基因组有关的数据库有dbEST、OMIM、GDB、GSDB等 2、 数据库搜索及序列比较 搜索同源序列在一定程度上就是通过序列比较寻找相似序列 序列比较的一个基本操作就是比对（Alignment），即将两个序列的各个字符（代表核苷酸或者氨基酸残基）按照对应等同或者置换关系进行对比排列，其结果是两个序列共有的排列顺序，这是序列相似程度的一种定性描述多重序列比对研究的是多个序列的共性。序列的多重比对可用来搜索基因组序列的功能区域，也可用于研究一组蛋白质之间的进化关系。 发现同源分子 3、 基因组序列分析 遗传语言分析——天书 基因组结构分析基因识别基因功能注释基因调控信息分析基因组比较 4、基因表达数据的分析与处理基因表达数据分析是目前生物信息学研究的热 点和重点 目前对基因表达数据的处理主要是进行聚类分 析，将表达模式相似的基因聚为一类，在此基 础上寻找相关基因，分析基因的功能 所用方法主要有：相关分析方法模式识别技术中的层次式聚类方法人工智能中的自组织映射神经网络主元分析方法 5、蛋白质结构预测 蛋白质的生物功能由蛋白质的结构所决定 ，蛋白质结构预测成为了解蛋白质功能的重要途径 蛋白质结构预测分为: 二级结构预测空间结构预测 二级结构预测 在一定程度上二级结构的预测可以归结为模式识别问题 在二级结构预测方面主要方法有：立体化学方法图论方法统计方法最邻近决策方法基于规则的专家系统方法分子动力学方法人工神经网络方法 预测准确率超过70%的第一个软件是基于神经网络的PHD系统 空间结构预测在空间结构预测方面，比较成功的理论方法是同源模型法 该方法的依据是：相似序列的蛋白质倾向于折叠成相似的三维空间结构 运用同源模型方法可以完成所有蛋白质10-30%的空间结构预测工作 第四节 GenBank数据库检索及其应用 ——Entrez检索功能 Nucleotide 数据库分为三个子数据库： EST :表达序列标记数据库 GSS :基因组测序序列数据库 CoreNucleotide :包含所有未被以上两个子数据库收录的核苷酸序列 检索限定词： 1、基因名称的检索限定词：[GENE] or [GENE NAME] 2、生物体名称的检索限定词：[ORGN] or [ORGANISM] 3、作者姓名的检索限定词：[AUTH] or [AUTHOR] 获取所需要的基因序列 保存序列信息 特殊标志符的格式(核酸序列)： 2、GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号： (1) 1个字母+5个阿拉伯数字 e.g.：U12345 (2) 2个字母+6个阿拉伯数字 e.g.：AY123456，Af123456 范围检索：中间用冒号连接 1、序列接受号范围检索： AF114696:AF114714[ACCN] 2、序列长度范围检索： 3000：4000[SLEN] 3、日期范围检索： 2005/01：2006/09/26[MDAT]or[PDAT] GenBank记录中特性表中的主要关键词: GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较： 1、GenBank的检索结果是序列及其注释信息； PubMed的检索结果是与序列数据相关的文献信息。 2、GenBank数据更新早于PubMed，GenBank数据库的检 全率高于PubMed。 3、GenBank可对序列数据进行限制检索，而PubMed只能对文献、杂志、作者等进行限制检索，因而GenBank数据库的检准率也高于PubMed。课后练习用 GenBank 数据库搜索 ”SARS coronavirus BJ01” 的全基因组序列信息并下载保存，查询该基因所产生的蛋白质序列信息。 用BLAST模块对该基因序列进行相似性搜索。yY9红软基地

生物信息学在蛋白质工程中的实际应用介绍PPT课件：这是一个关于生物信息学在蛋白质工程中的实际应用介绍PPT课件，主要介绍了什么是生物信息学、蛋白质研究常用的数据库、蛋白质序列分析和结构预测等内容。GenBank存储的数据类型基因组DNA数据库 染色体、大片段DNA（BAC或YAC）、基因、序列标签位点（STS） cDNA数据库 表达序列标签（EST）蛋白质数据库 非冗余数据库（nonredundant database） GSS 基因组测序序列随机的“经过单次测序”的基因组测序序列；粘粒/BAC/YAC序列外显子定位的基因组序列 Alu聚合酶链反应序列 EST cDNA克隆的一部分序列（300-800bp）。 EST序列通常是随机选出cDNA克隆并对其中一条链进行快速测序。 UniGene 一个基因的数据库条目，包含了所有这个基因对应的EST。 参考序列（RefSeq） 给出了一个对应于基因或蛋白质的索引号码，对应于最稳定、最被人承认的序列。 GenBank中对应于某个基因的索引号可能有上百个，但是对应于一个基因的RefSeq记录只有一个，或者在存在可变剪切的情况下对应不止一个，欢迎点击下载生物信息学在蛋白质工程中的实际应用介绍PPT课件哦。

生物信息学论文PPT模板：这是一个关于生物信息学论文PPT模板，主要介绍了引言、生物信息学发展的三个阶段、生物信息学的主要研究内容、生物信息学中的信息、生物信息学面临的8大挑战、基因变异使人类独具说话能力等内容。1 生物信息学引论 Gào Gāng 郜刚 gaogang20002000@126.com 13835702330 物质 能量 信息 生命活动三要素： 北京华大基因研究中心生物信息学平台 主要从事数据处理、软件开发、数据库建立与维护、项目研发、大型机管理、系统与网络维护等方面工作。其中数据处理和项目研发以计算机为工具，结合生物、数学、物理等多学科知识，对测序产生的原始数据进行处理和分析，获得传统生物学实验工作无法得到的结果。 1.1 引言 1.1.1 生物信息学概念 20世纪是科学技术迅速发展的世纪，物理和化学的发展使我们可以清楚地认识物质的组成，从分子、原子、电子等各层次上深入地了解微观世界，而天文技术、空间技术的发展则使得我们可以了解地球以外的客观世界，以电子信息技术为龙头的工业技术的飞速发展，使得我们可以不断地改造世界，甚至为人类更加舒适地生活创造新的世界。生命科学在20世纪同样也得到了发展，生理学、 细胞生物学、分子生物学等学科的发展使我们从器官、组织、细胞、生物大分子等各个层次认识了生命的物质基础。生物与其他物质有本质的区别，生物并非只是物质的简单堆积，生物体的生长发育是生命信息控制之下的复杂而有序的过程，欢迎点击下载生物信息学论文PPT模板哦。

生物信息学分析PPT课件：这是一个关于生物信息学分析PPT课件，主要介绍了引言、生物信息学及其发展历史、生物信息学基础、生物信息学主要研究内容、生物信息学当前的主要任务等内容。内容 生物信息学的应用–医学 新药物设计基因芯片疾病快速诊断流行病学研究：SARS 人类基因组计划寄生虫基因组计划 生物信息学？－－新兴的交叉学科 So, 生物信息学是一门交叉学科，它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方面，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具，来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。 (美国人类基因组计划第一个五年总结报告，1995) 采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对 各种生物信息的收集、加工、储存、分析、解释的一门学 科。收集、加工、储存：计算机科学家分析、解释：生物学家 20世纪50年代：生物信息学开始孕育 20世纪60年代：生物分子信息在概念上将计算生物学和 计算机科学联系起来 20世纪70年代：生物信息学的真正开端(序列比对算法) 20世纪80年代初期：生物信息分析方法的发展 20世纪80年代以后：生物信息服务机构和数据库 20世纪90年代后：HGP促进生物信息学的迅速发展 生物信息学主要研究内容，欢迎点击下载生物信息学分析PPT课件哦。