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序列拼接工具cap3-windows版
- 软件类型：
- 国产软件
- 软件语言：
- 简体中文
- 软件大小：
- 1 MB
- 软件授权：
- 免费软件
- 软件评级：
- 4
- 更新时间：
- 2017-05-12
- 应用平台：
- WinXP, Win7, WinAll
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序列拼接工具cap3-windows版，is for small-scale assembly of EST sequences with or without quality values.用于少量的序列拼接。
软件特点
利用正反向进行拼接，更正拼接错误、连接 contigs。
应用 reads 的质量信息。
自动截去 reads5`端、3`端的低质量区。
产生 Consed 程序可读的 ace 格式。
?CAP3 能用于 Staden 软件包的中的 GAP4 软件。
使用说明
程序运行命令行:
cap3 File_of_reads [options]
如： cap3 seq.fa
输入 序 列 是 普 通 的 FASTA 格 式 的核酸序列， 如 果 序 列 文 件 名 为 “ xyz ” ， 则 质 量 文 件 应 命 名 为“xyz.qual”，约束文件应命名为“xyz.con”。在命令行中只需输入序列文件，程序会自动在相应的目录中寻找相应的质量文件和约束文件。
一般质量文件和约束文件不对于CAP3来时说不是必须的，也就是当这两个文件不存在的时候程序按照设定的默认值来处理。
软件截图
序列拼接工具cap3-windows版