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染色体距离大小测算(NucType)

软件类型:
国产软件
软件语言:
简体中文
软件大小:
1 MB
软件授权:
免费软件
软件评级:
4
更新时间:
2017-05-22
应用平台:
WinXP, Win7, WinAll
软件简介

染色体距离大小测算(NucType)是一个方便的应用,需要衡量和比较染色体或染色体的生物学家设计。 您可以使用应用程序,以便测量两点之间的距离。该方案还可以分析染色体核型不对称指数从加载的图像文件或一个以前保存的项目。

软件特点

1)已组装到contig或者scaffold水平的基因组,无论是Sanger测序、二代测序或者三代测序完成的基因组,但是未组装到染色体水平均可。
2)基因组未知物种,Hi-C与常规de novo结合提高基因组组装水平。

软件说明

Hi-C之所以能用于基因组组装,是基于染色质片段间的交互强度呈现出随距离衰减的规律 Hi-C相互作用强度与距离关系
与遗传定律类似,这一规律可以用来判断scaffolds的分类及相邻关系。分以下三步:聚类—排序—定向(cluster-order-orient)。

相关介绍

染色体(Chromosome )是细胞内具有遗传性质的物体,易被碱性染料染成深色,所以叫染色体(染色质);染色体是细胞核中载有遗传信息(基因)的物质,在显微镜下呈圆柱状或杆状,主要由脱氧核糖核酸和蛋白质组成,在细胞发生有丝分裂时期容易被碱性染料(例如龙胆紫和醋酸洋红)着色,因此而得名。

软件截图

 染色体距离大小测算(NucType)

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染色体距离大小测算(NucType)
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